シーズン1-1 第1話
邦題:遥かなる地球 (ふるさと) へ(前編)
原題:Caretaker, Part I
あらすじ……キャスリン・ジェインウェイ艦長が指揮するUSSヴォイジャーは、カーデシアへの抵抗運動を続けるマキのメンバーを追って、あわただしく出航した。ところが船は謎の力で、マキの船とともに、遥か7万光年も離れた宇宙域へ飛ばされてしまう。
シーズン1-2 第2話
邦題:遥かなる地球 (ふるさと) へ(後編)
原題:Caretaker, Part II
あらすじ……行方不明になったキム少尉とベラナを探すジェインウェイたちは、ニーリックスと出会う。彼によるとアレイ型ステーションの“管理者”と呼ばれる生命体が保護するオカンパと呼ばれる種族が第5惑星の地下に住んでいて、二人はそこに囚われているはずだと聞く。
シーズン1-3 第3話
邦題:ブラックホールからの脱出
原題:Parallax
あらすじ……船内では連邦士官とマキ・メンバーとの対立が深まっていた。その時、ブラックホールのイベント・ホライゾンに捕まった船から救難信号が入って、ヴォイジャーはその救助に向かう。ブラックホールに捕まった船とは、いったい何か?
シーズン1-4 第4話
邦題:24時間の過去
原題:Time and Again
あらすじ……ヴォイジャーは、大規模な爆発の衝撃波を受けた。ジェインウェイたちは、その調査に向かって、24時間前に何かの大爆発が起き、文明が消滅したことを知る。ところが、ジェインウェイとパリスが亜空間の歪みに囚われて、爆発前の過去に消えてしまう。このままでは2人は大爆発に巻き込まれてしまうのだ。
シーズン1-5 第5話
邦題:盗まれた臓器
原題:Phage
あらすじ……チャコティ、キム、ニーリックスは、ダイリチウムがあるという小惑星に降りた。ところが、ニーリックスは何者かに襲われて、肺を奪われてしまう。ドクターが懸命の治療を続ける一方、ヴォイジャーは、恐るべき技術を持った犯人を追う。
シーズン1-6 第6話
邦題:星雲生命体を救え
原題:The Cloud
あらすじ……ヴォイジャーは、エネルギーを節約しながら、苦しい航海を続けていた。その時、近くに星雲を発見。星雲でオミクロン粒子を集めれば、エネルギーの補充になり、乗員の気晴らしにもなると、その中へ進入した。ところが星雲と思われた物体は生命体だった。
シーズン1-7 第7話
邦題:ワームホールの崩壊
原題:Eye of the Needle
あらすじ……ヴォイジャーはワームホールを発見した。入口が小さすぎて船が入ることはできないが、向こう側と連絡がとれるかもしれない。わずかな望みをかけて、探査装置を送り込むが、驚くべき結末が待っていた。
シーズン1-8 第8話
邦題:殺された者の記憶
原題:Ex Post Facto
あらすじ……近隣の惑星ヌミリと交戦中のベイニア。ヴォイジャーはベイニアの技術を利用してアルファ宇宙域へのショートカットの方法を探ろうとするが……。
シーズン1-9 第9話
邦題:来世への旅
原題:Emanations
あらすじ……ある星の輪の中に、247番目の元素にあたる新元素を発見。調査に向かったチャコティ、キム、トレスは、放置された多くの死体を見つけた。どうやら新元素は、死体の崩壊過程で生じたものらしい。ところがキムは、死体を送り出している星へ飛ばされて、来世の存在を信じている種族と出会う。
シーズン1-10 第10話
邦題:転送・4万光年
原題:Prime Factors
あらすじ……もてなしの精神で有名なシカリス星に立ち寄ったヴォイジャーは、つかの間の上陸休暇を楽しんでいた。すると、そこには4万光年もの距離を転送できる装置があることがわかって、帰還への期待が高まっていく。ところが、技術を提供することはできないという、シカリスの規則で、ジェインウェイは苦境に立つ。
シーズン1-11 第11話
邦題:裏切り者
原題:State of Flux
あらすじ……ケイゾン・ニストリムの船からの救難信号を受けて、ヴォイジャーは調査に向かった。しかし、爆発事故の原因が連邦の装置であることから、それがヴォイジャーから持ち出されたことがわかった。はたして、船内にケイゾンと通じている“裏切り者”がいるのだろうか?
シーズン1-12 第12話
邦題:英雄伝説
原題:Heroes and Demons
あらすじ……ホロデッキで古代劇のベオウルフを楽しむクルーたち。ところが、クルーが忽然と姿を消す事件が発生した。
シーズン1-13 第13話
邦題:幽体離脱
原題:Cathexis
あらすじ……チャコティとトゥヴォックが乗ったシャトルが、暗黒星雲の近くで攻撃を受け、チャコティは脳死状態でヴォイジャーに戻った。そして船内には謎のエイリアンが侵入していた。
シーズン1-14 第14話
邦題:二人のトレス
原題:Faces
あらすじ……パリス、トレス、ダーストの3人は、上陸活動中、ヴィディア人に捕まってしまった。そしてトレスは、生体実験で、クリンゴン人と地球人の、2つの体に分解されてしまう。2人のトレスはどうなるのか?
シーズン1-15 第15話
邦題:殺人兵器メトリオン
原題:Jetrel
あらすじ……大量破壊兵器であるメトリオン爆弾の生みの親ジェトレル博士が、ハーコニアからやって来た。メトリオン放射による不治の病の治療法を完成するために、ニーリックスの体を検査したいという。しかし、その爆弾によるライナックスの大虐殺を経験したニーリックスは博士をけっして許そうとしない。
シーズン1-16 第16話
邦題:バイオ神経回路
原題:Learning Curve
あらすじ……バイオ神経回路のジェルパックに異常が起きた。マキのメンバーであるダルビーが勝手に修理をしたことがきっかけで、トゥヴォックがマキの教育を始める。しかしアカデミー方式の厳しい訓練にマキたちの不満が爆発。一方、ジェルパックの異常はおさまらず、船の機能が次第に麻痺し始めた。